Герб Губкинского городского округа утвержден в 2008 году. В его основу положена идея стилизованного изображения главной отличительной особенности местности - магнитной аномалии и основной отрасли промышленного производства - добычи и переработки железистых кварцитов, а также развитое агропромышленное производство на землях Губкинского городского округа.
Золотой колос символизирует развитое агропромышленное производство.
Таким образом, на гербе отражены главные особенности Губкинского городского округа и возникающие в связи с этим ассоциации: «железо» - «магнит» - «аномалия» - «сельское хозяйство».